書舍捐贈後的十餘年間，其命運並非一帆風順，而是經歷了公共屬性與商業利益的激烈博弈。在捐贈初期，杭州西湖文化研究會等文化機構合法入駐，書舍對外開放，遊客只需花費人均35元即可入內品茗、閱讀金庸著作，基本實現了金庸「文人雅集」的初衷。 然而，在商業利益的強烈驅使下，西元2008年3月，書舍內部進行了大規模的重新裝修，原有的文化機構被「清理」出門。隨後，書舍被管理方（靈隱管理處下屬企業）承包並改造成為一家主營杭幫菜和譚家菜的高檔私人會所。會所的經營模式極度奢華，主樓「松風明月樓」上下樓每天僅設兩席，最低消費高達每人500元起步，加上高檔酒水，每餐動輒上萬元人民幣；就連最基本的喝茶服務也暴漲至100元一位。更令人痛心的是，有文化界人士指出，金庸當年親自購置的部分貴重傢俱與臥床也一度從樓上臥室消失（後管理方澄清因書舍相對潮濕，已轉移至下沙地區妥善保管，否認資產被挪用）。 西元2012年5月，中新網、《華西都市報》等權威媒體對此商業化牟利行為進行了深度曝光，引發了強烈的社會反響與公眾憤怒。公眾與學者一致認為此舉嚴重違背了金庸先生無償捐贈的初衷。面對輿論壓力，杭州市園文局靈隱管理處迅速介入，於當年暫停了書舍的餐飲服務並提出多條整改意見以加強管理。 真正的徹底轉折發生在西元2014年初。隨著中共中央紀委與相關領導小組聯合下發嚴肅整治「會所中的歪風」的專項通知，杭州市委市政府高度重視，堅決落實「還湖於民」的宏觀政策。在此次整治行動中，包括馬雲創辦的「江南會」以及「雲松書舍」在內的多家位於西湖景區的高檔經營會所被正式關停，並重新規劃管理，明確要求經營場所一律向廣大遊客和市民開放，實行明碼標價。如今，雲松書舍已徹底回歸其公共文化屬性，作為西湖景區的免費景點向廣大遊客常態化開放，其茶空間也轉向面向社會預約使用的公共文化雅集場所，供舉辦插花交流、會務接待等活動。這一波折，不僅是雲松書舍發展史上的重要陣痛期，更是中國現代文化遺產保護從「資本化侵蝕」向「公共利益回歸」的標誌性歷史事件。